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簡易課税制度は、インボイス制度導入後も変更ありません。簡易課税制度選択適用事業者は、インボイス制度導入後も売上げに係る消費税額を基礎として仕入れに係る消費税額を算出することになるため、適格請求書の保存等は仕入控除の要件になりません。原則課税に比べて仕入控除税額の算出が簡単であるため、簡易課税制度の選択が増加が見込まれます。